入团申请书是谁保管的，入团申请书是团组织保管的。入团申请书由团组织保存，如果是在学校入团，就由学校团组织归入团员档案保存。入团申请书是要求加入团组织的青年向中国共产主义青年团组织递交的表达自己想要加入团组织的一种文书。

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